Unabhängig vom Problem solltest du den neuesten Patch installieren, falls du das noch nicht getan hast.
MP3-Dateien können durchaus Probleme verursachen. Das gilt aber für alle Schnitt-Programme. Vor allem MP3 mit variablen Bitraten bereiten die größeren Schwierigkeiten.
Ab der PLUS-Version gehört der Music-Editor zum Lieferumfang. Versuche damit die Dateien in WAV umzuwandeln oder nutze andere Freeware (Audacity) dazu.
Diese Wandlung ist zur Bearbeitung von komprimierten Formaten zwingend notwendig. VDL erledigt das eigentlich beim Import von selbst. Aber in deinem Fall versagt das eben.