Das ist dann der Fall, wenn Du beim Erstellen des Projekts die Option für einen eigenen Projektordner aktiviert hast, in den die Medien kopiert werden. Das Projekt nutzt dann die kopierten Medien und eben nicht die Originale.

So gesehen ist es nur normal, dass die Originale keinen roten Punkt als Markierung bekommen.

Schöne Grüße,

Markus