Heute habe ich Antwort von Magix-Support bekommen:

Der Mainconcept Encoder wird nicht mehr unterstützt. Aus Kompatibilitätsgründen wurde er allerdings im Programm belassen. Daher kann es bei der Nutzung zu Problemen kommen.
Bitte wechseln Sie in Ihre Programmeinstellungen in den Reiter "Import/ Export" und stellen dort den "Standardencoder" ein. Prüfen Sie Ihren Export dann erneut.