Über dieses Thema ist hier schon mehrfach geschrieben worden und es gibt dazu auch einen Workshop:
http://www.magix.info/de/website-maker-3-hauptnavigation-unternavigation-bauen.online-training.22516.html
Trotzdem hier kurz eine Erklärung:

Auf der Seite, in die du eine Unternavigation einbauen möchtest, suchst du bei "Objekte" - "Navigation" eine Navigation aus und fügst sie auf die Seite ein. Dabei ist es egal, ob du eine horizontale oder vertikale nimmst, sie muss dir nur gefallen. Wenn du sie auf die Seite eingefügt hast, nicht erschrecken - es werden alle Seiten, die deine Homepage hat, aufgelistet. Klicke die Navigation an (markieren) und gehe dann auf "Eigenschaften". Dort wiederum auf den Unterpunkt "Navigation". Hier werden alle deine Seiten aufgelistet. Alle, die ein gelbes Auge haben, werden in der Navigation angezeigt, die du gerade markiert hast. Um sie aus der Unternavigation zu entfernen, einfach das gelbe Auge anklicken, es ist dann grau unterlegt. So machst du es mit allen Seiten, die nicht in dieser Unternavigation stehen sollen.
Jetzt gehst du auf die nächste Seite deiner HP, die auch zu diesem Thema gehört und wiederholst diesen Vorgang.
Sollten evtl. in deine Hauptnavigation noch Seiten angezeigt werden, die du jetzt als Unterseiten gemacht hast, kannst du diese Seiten aus der Hauptnavi auch entfernen. Dazu musst du die Seite "Navigation" auswählen und dann auch wieder diese Navigation markiern, über "Eigenschaften" - "Navigation", genau wie oben beschrieben, bearbeiten.
Gruß Rosl