Grundsätzlich lassen sich Flash Dateien per Platzhalter im WD6 einbinden. Ich selbst habe in meinem Projekt auch Flash integriert.
Kannst Du mal den Quellcode posten oder mir per Mail zukommen lassen? Ich kann mir vorstellen, dass es daran liegt. Ich setze mal Voraus, dass Du den FlashPlayer bei Dir installiert hast.